華大基因家蠶超級泛基因組圖譜繪就入選2022國內十大科技新聞

近日,由中央廣播電視總臺發布的2022年度國內、國際十大科技新聞名單正式揭曉。其中,西南大學家蠶基因組生物學國家重點實驗室主任、國家蠶桑產業技術體系首席科學家代方銀教授團隊聯合華大基因等單位合作完成的家蠶超級泛基因組項目成功入選2022年度國內十大科技新聞。

研究團隊通過對1078份蠶種質資源進行了深度短讀長測序,對其中545份代表性資源進行了長讀長測序,產生55.57T基因組數據,組裝了545個蠶的高質量基因組,對100個基因組進行了基因注釋,鑒定到4,300余萬個SNP、930余萬個Indel、340余萬個結構變異(SV)和7,308個新基因(家族),繪制了一個高精度家蠶泛基因組圖譜。該圖譜包含了目前全球最全面的家蠶與野桑蠶基因組信息,是全球動植物領域樣本量最大的長讀長泛基因組。此外,研究團隊在全球率先構建家蠶基因數據庫,對于開啟家蠶設計育種,賦能“改造家蠶、多元利用”等,將有重要深遠的意義。

華大基因千蠶高精度基因遺傳變異圖譜入選2022國內十大科技新聞

由于家蠶可視遺傳性狀豐富,基因組大小合適,對家蠶的基因組研究將對害蟲防治等具有重要應用價值。早在2003年,日本率先開啟了家蠶基因組計劃,該計劃曾與曼哈頓原子彈計劃、阿波羅計劃并稱為20世紀三大科學計劃的國際人類基因組計劃。

作為我國基因行業的奠基者,華大基因曾助力完成人類基因組計劃1%測序工作和水稻基因組項目,擁有成熟穩定的基因組測序能力和世界領先的組裝拼接技術。為了讓中國重新掌握桑蠶業的話語權,華大基因積極加大研發資源投入,為西南大學家蠶基因組研究團隊提供技術支持,同時在測序組裝、信息分析等方面提供專業支持。

時至今日,隨著國內外動植物基因組研究的不斷深入,越來越多物種的泛基因組被相繼公布,泛基因組現已在動植物基因組學研究中被廣泛用于更為全面地評估物種內遺傳多樣性。華大基因基于自主研發的多組學技術Stereo-seq,為研究團隊提供“亞細胞級分辨率”和“厘米級全景視場”的技術,并同時實現基因與影像的同時分析。憑借在動植物基因組學的研究經驗總結,華大基因為研究團隊提供長讀長+短讀長測序結合Hi-C技術研究策略。

未來,華大基因將為更多科研機構、企事業單位等提供多組學技術支持與服務,攜手研究新興模式生物,不斷優化升級多組學技術,為基因組變異和優良基因的深度挖掘提供科學支撐,助力動植物育種新突破。

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